ИИ научился взламывать человеческую ДНК — и делает это чище, чем человек.
Исследователи из США представили первый в мире искусственно спроектированный фермент CRISPR, созданный с помощью генеративного ИИ. Новый белок под названием OpenCRISPR-1 эффективно редактирует ДНК человека и потенциально решает сразу несколько проблем, которые ограничивают применение традиционных CRISPR-систем в медицине — от побочных мутаций до иммунного ответа.
Работа опубликована в Nature. Авторы проекта — команда под руководством Ричарда Руффоло. Их подход основан на языковых моделях белков, аналогичных GPT, только обученных на миллионах аминокислотных последовательностей. В процессе они собрали новую базу данных — CRISPR–Cas Atlas, в которую вошли более миллиона CRISPR-операнов, выделенных из 26,2 трлн нуклеотидных пар микробных геномов.
После двух этапов дообучения модели на 240 тыс. последовательностях Cas9 и генерации 350 тыс. новых вариантов, учёные выбрали 209 кандидатов и протестировали их в клетках человека. Лучшая из них — OpenCRISPR-1 — показала точность редактирования на уровне классического SpCas9, но с в 20 раз меньшим числом побочных срезов. Более того, её мутации практически не совпадают с известными вариантами, что делает белок менее заметным для иммунной системы.
Источник : https://www.securitylab.ru
